search
技术服务021-34781616

欧易生物

热门搜索关键词:转录组基因组甲基化酵母文库蛋白芯片

021-34781616

当前位置凯发k8凯发k8网址官网下载首页 » 新闻资讯 » 技术&解读&应用 » 甲基化检测揭示孕妇吸烟对婴儿表观遗传的影响

甲基化检测揭示孕妇吸烟对婴儿表观遗传的影响

来源: 查看手机网址
扫一扫!扫一扫!
浏览:- 发布日期:2017-12-27 15:47:25【 】

01

孕妇的身体状况对于胎儿健康有着重要影响,有研究表明,孕期饥饿会增加新生儿患ii型糖尿病、心血管疾病的概率,还可能降低新生儿的认知能力。而孕期尤其是产前吸烟会使新生儿更易患肺部疾病、肥胖症以及癌症。

今天给大家分享的这篇文献,从表观遗传学的角度告诉了我们孕期吸烟对新生儿所带来的影响,包括dna甲基化、组蛋白修饰,并从转录组水平对其进行了认证。

02

文章思路

值得注意的一点是,在对不同样本的甲基化检测数据处理时,该研究通过snp calling将差异甲基化区域dmr(differentially methylated regions)区分为了两类,遗传性导致的dmr(gdmr)和非遗传因素导致的dmr(ngdmr),这样处理更好的表明了吸烟对新生儿dna甲基化的影响,排出了遗传因素的干扰。此外,该文章还通过纵向研究,即对新生儿出生4岁后进行wgbs检测,回答了孕期吸烟对新生儿dmr的影响是暂时性还是持久性的问题。

03

研究结果

1、在母亲和孩子之间与孕期吸相关的基因组甲基化变化不同。

在新生儿出生时,检测到的非遗传导致的甲基化位点变化在新生儿中有1404个,母亲中有1953个,包括超甲基化位点和低甲基化位点。

2、孕期吸烟导致的新生儿dna甲基化变化是持久性的。

对新生儿刚出生时以及出生后4年时进行wgbs检测发现,超甲基化区域随着年龄增大呈现高稳定性。说明吸烟对新生儿dna甲基化变化的影响是持久性的。

3、与吸烟相关的dna甲基化变化与超变染色质(hypervariable chromatin)有关

通过chip-seq对六组母亲和新生儿进行组蛋白修饰检测,发现了与吸烟相关的dna甲基化变化位点在染色质上的位置。

4、吸烟通过影响表观遗传重组调控基因组表达元件

因为发现只有一小片段

dmrs是位于tss,所以研究者认为可能是其他位点的甲基化影响了基因表达,chip seq结果显示可能是位于tss位点以外的活跃或静止的增强子。这种与甲基化位点有重复区域的增强子被命名为dmes。

通过多位点突变发现,在母亲和新生儿的dmes区和抑制子区均有ngdmrs的富集,而在启动子区却相对低。

5、吸烟导致的表观遗传重组在转录水平上的反应

通过rna-seq以及chia-pet分析和dhs–启动子预测,发现dmrs影响的靶基因包括wnt信号通路中的62个基因(母亲)和48个基因(新生儿)。而且环境导致的甲基化位点的变化在转录水平随着新生儿增大,其作用效果扩大。

6、案例验证

选择

j

nk2增强子作为研究对象(jnk2是wnt信号通路中的一员,与copd和肺癌有关),通过massarray检测,发现随着产妇体内可替宁含量增加,婴儿脐带血中检测到的该区域超甲基化现象增多。而且与不吸烟的产妇和新生儿相比,吸烟者jnk2 增强子区存在活跃的染色体。

7、增强子区甲基化变化对性状影响的体外验证

研究者患有哮喘的新生儿进行了dna甲基化检测,发现jnk2增强子区的dna超甲基化有较高的哮喘发作率。并利用jnk2缺失大鼠对此进行了验证。

04

参考文献

bauer t, trump s, ishaque n, et al. environment‐induced epigenetic reprogramming in genomic regulatory elements in smoking mothers and their children[j]. molecular systems biology, 2016, 12(3):861.

推荐阅读

【本文标签】:
【责任编辑】:欧易生物凯发k8官网下载的版权所有:http://www.oebiotech.com转载请注明出处

欧易生物

技术热线:021-34781616 咨询热线:4006-4008-26

上海市闵行区新骏环路138号5幢3层
service@oebiotech.com
欧易生物
欧易生物微信公众号
 网站地图  凯发k8官网下载 copyright © 2016 凯发k8官网下载 保留所有权利