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可视化比对软件mega 5.2.2的使用

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浏览:- 发布日期:2016-09-30 14:34:24【 】

mega是一款非常方便的windows系统的可视化序列比对软件,今天就以fasta格式的多序列比对为例来浅谈使用方法。

首先下载安装mega,双击点开

选择open a file/session

选择第一个新建一个新比对

根据fasta序列的属性选择(核酸dna或是蛋白protein):

然后会跳出一个新的窗口,导入我们的序列

导入后,会看到如下的界面

可以通过图上红色部分的标签来把核酸序列翻译成蛋白,一般翻译是标准的,如果有特殊的密码子也可以通过勾选对话框进行,我们这里选择默认的标准

跳出参数设定的窗口,可以默认,直接点击ok

稍作等待,得到结果

当然,我们这里是通过把核酸翻译成蛋白进行比对,也可以直接对核酸序列进行比对

以上只是mega软件的最基本功能,还可以利用它构建系统发育树等,更深入的探究可以找欧易助您一臂之力

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