search
技术服务021-34781616

欧易生物

热门搜索关键词:转录组基因组甲基化酵母文库蛋白芯片

021-34781616

当前位置凯发k8凯发k8网址官网下载首页 » 新闻资讯 » 技术&解读&应用 » 转录组测序解释mirna对牛奶中脂质含量的影响

转录组测序解释mirna对牛奶中脂质含量的影响

来源: 查看手机网址
扫一扫!扫一扫!
浏览:- 发布日期:2017-11-06 09:46:28【 】

目前,牛奶已经成为大众喜爱的饮品之一,素有“白色血液”的美誉。主要营养成份有脂质、蛋白质、乳糖、无机盐等,而其中脂类的成份占到3.5%到4.2%之间。在这些脂质中,有70%的饱和脂肪酸(当过度消耗时不利于身体健康),25%的非饱和脂肪酸(有利于身体健康)和5%的多聚非饱和脂肪酸。有篇文献的研究表明,在牛的饲料中加入适量的植物油(亚麻油和红花油)后,会使得牛奶中饱和脂肪酸的含量下降,非饱和脂肪酸含量的上升。

文献作者在牛的日常饮食中加入了5%的亚麻油和红花油,观察到牛奶中脂类的总体含量下降,并且发现在实验组的脂质中,饱和脂肪酸的含量整体下降,而非饱和脂肪酸的含量整体呈上升趋势。

day-14:对照组喂养14天;day+7和day+28:实验组喂养7和28天

随后,作者对牛乳腺组织进行了转录组,经过深度,一共获得了3.6亿条reads,其中有67.2%的reads成功匹配到基因。在这些匹配到基因的 reads中,s占到绝大多数(82.2%)。

左图:

所有reads的map情况

右图:

的分类图

那么,有哪些mirna的表达受到影响了呢?作者通过对比实验组喂养28天和对照组喂养14天的数据,发现亚麻油组共有14种的表达发生了变化,其中有11种mirna上调,3种下调;而在红花油组中,共有22种mirna的表达发生了变化,其中有10种mirna上调,12种下调。选取部分mirna利用qpcr实验进行验证,发现除个别基因外,其余基因均符合上下调的变化。

上图(a):亚麻油组部分基因qpcr和mirna-seq结果;

下图(b):红花油组部分基因qpcr和-seq结果。

为了进一步探索这些变化的在牛奶中脂类合成过程中的作用,作者用ipa软件对两种实验组均发生变化mirna进行靶基因的预测,并对预测到的靶基因进行功能分析,发现大多数的靶基因与脂质的合成和储存具有相关性。

文献作者通过利用转录组的方法,揭示了实验组中的表达情况,发现许多差异表达的mirna,并进行了功能预测,为进一步了解牛乳腺中脂质的合成途径奠定了基础。

推荐阅读

【本文标签】:
【责任编辑】:欧易生物凯发k8官网下载的版权所有:http://www.oebiotech.com转载请注明出处

欧易生物

技术热线:021-34781616 咨询热线:4006-4008-26

上海市闵行区新骏环路138号5幢3层
service@oebiotech.com
欧易生物
欧易生物微信公众号
 网站地图  凯发k8官网下载 copyright © 2016 凯发k8官网下载 保留所有权利