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itraq/tmt标记定量蛋白质组

itraq和tmt是目前运用较为广泛的两种标记定量蛋白质组技术,通过与肽段n末端基团结合(还可以与赖氨酸侧链氨基进行结合。除了这两个结合位点,tmt不同类型试剂还有多种结合位点),实现对多肽的标记,并通过不同分子量的试剂对不同来源样品进行标记的方式实现不同样品间蛋白质组比较的目标,结合报告离子的峰面积计算同一蛋白质同一肽段在不同样品间的比值,从而实现蛋白的定量比较。

技术流程

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服务优势

定量准确:可以检测至少百分之五的差异
重复性好:相比双向电泳等技术具有更好的重复性
数据丰富:分离出的蛋白都有定性和定量信息
通  量  高:itraq可以同时进行8个不同样品的分离分析(tmt上限为10个)
分辨率高:一次实验可实现几千个蛋白的分析并对低丰度蛋白有较强的检测能力

案例展示

案例一  显微切割组织的比较蛋白组分析发现膀胱癌的新分子标志物

实验材料
四例膀胱癌样品及癌旁组织
研究结论
发现癌组织中包括有机物响应、无机金属离子响应、无机物响应在内的多个生物学过程中对应的蛋白出现显著上调。
肿瘤细胞中三个蛋白slc3a2、stmn1和tagln2的含量严重超标,并预示着tagln2很有可能是一个有效的肿瘤组织诊断标志物,可用于评估膀胱癌患者的淋巴结转移情况 (auc=0.999)。

参考文献

chen c. et al., comparative tissue proteomics of microdissected specimens reveals novel candidate biomarkers of bladder cancer. 2015, mol. cell. proteomics.


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