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1602月
重磅干货:转录组测序常见问题
转录组测序常见问题
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2005月
转录组测序常见faq
转录组测序常见faq
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2801月
什么是snp、snv(单核苷酸位点变异)?
单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,snp) 和单核苷酸位点变异(single nucleotide variants, snv)。个体间基因组dna序列同一位置单个核苷酸变异(替代、插入或缺失)所引起的多态性。不同物种、个体基因组dna序列同一位置上的单个核苷酸存在差别的现象。有这种差别的基因座、dna序列等可作为基因组作图的标志...
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1506月
微量样本,实验如何继续?
俗话说,巧妇难为无米之炊,做科研也不例外。一个实验的完成,离不开足够多、足够好还要满足实验条件的样本,可以说样本准备好了,实验就已经成功了一大半了。可是,事与愿违的情况比比皆是,好不容易有个好想法,样本的获得却受许多条件的限制,比如要研究的目标是特定组织或细胞,这类实验的材料取材很难达到常规实验要求...
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1602月
truseq微量转录组是什么?
truseq真核转录组是指通过使用illumina? truseqtm rna sample prep kit对样品进行微量建库,并基于高通量测序平台全面快速获取mrna信息的测序产品。
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2801月
什么是copy number variation (cnv):基因组拷贝数变异?
基因组拷贝数变异是基因组变异的一种形式,通常使基因组中大片段的dna形成非正常的拷贝数量。例如人类正常染色体拷贝数是2,有些染色体区域拷贝数变成1或3,这样,该区域发生拷贝数缺失或增加,位于该区域内的基因表达量也会受到影响。如果把一条染色体分成a-b-c-d四个区域,则a-b-c-c-d/a-c-b-c-d/a-c-c-b-c-d/a-b-d分别发...
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2801月
什么是indel (基因组小片段插入)?
基因组上小片段(>50bp)的插入或缺失,形同snp/snv。
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2801月
什么是sanger法测序(一代测序)?
sanger法测序利用一种dna聚合酶来延伸结合在待定序列模板上的引物。直到掺入一种链终止核苷酸为止。每一次序列测定由一套四个单独的反应构成,每个反应含有所有四种脱氧核苷酸三磷酸(dntp),并混入限量的一种不同的双脱氧核苷三磷酸(ddntp)。由于ddntp缺乏延伸所需要的3-oh基团,使延长的寡聚核苷酸选择性地在g、a、t或c处终...
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2801月
什么是高通量测序技术?
高通量测序技术(high-throughput sequencing,hts)是对传统sanger测序(称为一代测序技术)革命性的改变, 一次对几十万到几百万条核酸分子进行序列测定, 因此在有些文献中称其为下一代测序技术(next generation sequencing,ngs )足见其划时代的改变, 同时高通量测序使得对一个物种的转录组和基因组进行细致全貌的分析成为...
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