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宏基因组测序

宏基因组测序

基因组学(metagenomics),又称元基因组学,是由 handelman 提出的一种直接对微生物群体中包含的全部基因组信息进行研究的手段,以特定生境中的整个微生物群落为研究对象,采用高通量测序技术,获得环境微生物基因组信息总和,以研究环境微生物的群落结构、物...

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微生物多样性:16s/18s/its等扩增子测序

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微生物多样性测序是基于第二代高通量技术对16s rrna/18s rrna/its等基因序列进行测序,能同时对样品中的优势物种、稀有物种以及一些未知的物种进行检测,获得样品中的微生物群落组成以及它们之间的相对丰度。探讨微生物多样性对于研究微生物与环境的关系、环境...

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细菌、病毒甚至癌细胞通畅存在于与变异密切相关的复杂群体中。这些变异会响应环境变化,例如免疫压力或药物治疗造成的快速进化。使用二代测序对复杂群体进行鉴定需要复杂的组装算法,使得混合群体中相关度非常高的个体的区分变得非常困难。sequel系统可从病毒...

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搭乘单细胞测序快速列车,推动生命科学快速发展

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前 言 单细胞测序技术虽然已有近10年的发展历史了,至今也有接近2000篇文章发表,但与其应用潜力相比,还远远不够。其原因除了认知等方面外,主要是前期的单细胞测序费用昂贵,一个细胞需要数千至上万元,而一个项目至少测上千个细胞。高昂的费用大大限制了其应用。 近年来,随着10× genomics等单细胞测序技术的发展,大大降低了实验成本,每个细胞的实验费用已经降到了10元左右。另外,分析方法也逐步发展成熟。一个项目投入一二十万,就可能在很短的时间内得到有意义的结果了。 【更多详情】

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